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芯片服务

美国Affymetrix公司（昂飞公司）是最早开发和研制基因芯片的公司，拥有对GeneChip的注册专利。Affymetrix的基因芯片为高密度寡核苷酸芯片，利用原位光刻专利技术可使一张芯片上合成多达500,000个寡核苷酸。这种类型的芯片具有极高的特异性和灵敏度，重复性好，假阳性率非常低，是目前世界上最先进的基因芯片。因其具有强大的检测功能，己被广泛地应用于基因表达分析、基因分型和健康诊断等研究，大大加速了人类以及其它模式生物基因组学研究的进程。

应用领域

1.基因功能研究；
2.基因表达谱分析、基因诊断、序列分析；
3.药物筛选与新药开发；
4.基因多态位点（SNP）及基因突变检测；
5.其他方面的应用，如环境保护、农业和蓄牧业等领域的应用
服务内容：
表达谱芯片服务
全基因组SNP芯片服务
我们还将提供以下方面的数据及分析结果： 1. jpg格式芯片扫描原始图像。
2. 芯片的原始数据，包括原始的.DAT、.EXP和.CEL文件。
3. Excel文件形式提供每张芯片的分析结果。包含样品中所有基因的Signal、Detection和Detection p-value等信息。
4. 每张芯片的Report文件。包含样品的制备质量和芯片杂交的总体信息。
5. 对不同的样本进行基因差异表达的比较分析，比较分析的次数不多于客户要求服务的芯片数。并以Excel格式提供所有基因在不同芯片中表达差异分析。得到Change p-value, Increase 或Decrease等信息。
6. 提供不同样本比较分析散点图(Scatter Graph)。可以直观地反映两者信号值强度的整体差异及分布（分析次数不超过客户要求服务的芯片数目）。
7. 样品提交：
8. 客户可提供样品组织或RNA，我们负责
9. 1.将保存在液氮或者RNAlater中的组织中提取RNA样品并进行纯化、质量检测，每份样品每次实验额外收费300元。
10. 2.将通过研磨保存在Trizol中的组织中提取RNA样品并进行纯化、质量检测，每份样品每次实验额外收费200元。
11. 3.将保存在Trizol中的细胞中提取RNA样品并进行纯化、质量检测，每份样品每次额外收费200元。
12. 4.将保存在>75%的乙醇中的RNA样品中回收RNA样品并进行纯化、质量检测，每份样品每次实验额外收费100元。
13. 5.将保存在DEPC水中的RNA样品进行质量检测，每份样品每次实验收费100元。
14. 6.如由于我们提取不当导致样品不符合要求，我们免费为客户再次提取样本；若由于客户提供的样本质量不符合当初的条件约定，则客户再次提供样本时，需要再次检测并收费。
15. RNA质量判定标准：RNA进行2100电泳，有清晰的28S、18S rRNA条带，且28S条带亮度约是18S的1-2倍，RNA样本OD 260/280应在1.7-2.1之间，RIN一般在8以上（组织提取的RNA一般RIN需7以上）; 符合标准的RNA经过柱纯化后可进行探针标记.

1.3’端表达谱芯片服务

3’端表达谱芯片，通过RNA末端反转录机制，将检测目标集中在RNA3’端区域。同时配套有agilent 2100 bioanalyzer，可精确分析核酸的降解情况。

本公司对人类、大鼠、小鼠等模式生物长期提供备货，对其他物种的芯片采取预约，随后我们会帮您购买并进行实验研究。可提供的芯片类型如下表。

Human Genome U 133A 2.0 Array	人类	该芯片涵盖了 18,400 个转录本，代表了 14,500 明晰的基因
Human Genome U133 Plus 2.0 Array	人类	该芯片包括人类全基因组 47,000 个转录本，包括了已报道的 38,500 个明晰的人类基因和 EST
Rat Genome 230 2.0 Array	大鼠	该芯片包含有 31,000 个探针组，代表 28,000 个明晰的大鼠基因。
Mouse Genome 430 2.0	小鼠	该芯片包涵有 45000 对探针，用来检测 34000 个基因的 39000 个转录子。
Mouse Genome 430A 2.0	小鼠	该芯片可检测 14000 个比较明确的小鼠基因。
Arabidopsis ATH1 Genome Array	拟南芥	拟南芥芯片可以检测 2000 年前报道的超过 24000 个基因的序列，可以用来研究植物基因时间和空间的表达分布。
Rice Genome Array	水稻	该芯片包括了 Genbank ， dbEST 和 UniGene 中报道的粳稻和籼稻 51279 个转录本，其中包括了 48564 个粳稻的转录本和 1260 个籼稻的转录本。
E. coli Genome 2.0 Array	大肠肝菌	该芯片可以检测大肠杆菌 K12 菌株和 O157 ： H7-Sakai 、 O157 ： H7-EDL933 和 CFT073 三个致病菌株，对应了上述四菌株 20366 个基因。
Yeast Genome 2.0 Array	酵母	该芯片包括了检测 S. cerevisiae 的 5841 个基因的探针，也包括了检测 S. pombe 全部 5031 个基因的探针。该芯片可以灵敏的检测出两种酵母的差异同时也能检测出和这两种酵母亲缘关系密切的品种。
C. elegans Genome Array	线虫	该芯片可以检测约 22,500 个线虫转录子的表达。
Zebrafish Genome Array	斑马鱼	斑马鱼芯片包括了在 Genbank, dbEST 和 Unigene 数据库中报道 14900 个斑马鱼的转录子。
Plasmodium/Anopheles Genome Array	疟原虫	该芯片包括约 4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约 14,900 Anopheles gambiae 转录子。
Bovine Genome Array	牛	该芯片可以检测约 23,000 个牛的转录子，对应 19,000 个同源基因。
Canine Genome 2.0 Array	狗	该芯片可以检测 18,000 个犬的 mRNA/EST 转录子，和超过 20,000 个非冗余的预测基因。
Chicken Genome Array	鸡	该芯片可以检测鸡的 32,773 个转录本。还包含了 17 种病毒的 684 个转录子。
Drosophila Genome 2.0 Array	果蝇	该芯片可以检测约 18,500 个果蝇转录子的表达。
Porcine Genome Array	家猪	该芯片上具有 23,937 个探针，对应 2004 年 8 月以前 Genbank ， dbEST 和 UniGene 报道过的家猪 20,201 个基因的 23,256 个转录本。
Rhesus Macaque Genome Array	恒河猴	恒河猴基因芯片组点可以检测 2004 年 10 月前报道的 Genbank, dbEST 和 Unigene 数据库中的 47000 个转录子，以及一些相关病毒的基因。
Xenopus Tropicalis Genome Array	非洲爪蟾	该芯片可以检测 UniGene, Genbank, DOE Joint Genome Institute, 和 Ensembl 上报道的约 51,000 X. tropicalis 转录子。
Xenopus Genome Array	爪蟾	该芯片可以检测 GenBank, dbEST, 和 UniGene 上报道的约 -4,400 Xenopus laevis 转录子。
Wheat Genome Array	小麦	小麦基因组芯片包括了 61127 个探针组，覆盖了 2004 年 4 月之前 Genbank, dbEST 和 Unigene 数据库报道主要的小麦经济品种 42 条染色体上的 55052 个转录本。
Citrus Genome Array	柑橘	该芯片包括了 30,171 个探针组，覆盖了 33,879 个柑橘转录本。
Cotton Genome Array	棉花	该芯片包括了 23,977 个探针组，覆盖了 21,854 个棉花转录本。
Maize Genome Array	玉米	该芯片覆盖了 B73, Ohio43, W22, W23, W 64A 和墨西哥黑甜玉米等品种。涵盖了约 13,339 个基因和大约 14,850 个玉米的转录本。
Medicago Genome Array	苜蓿	该芯片包括了 61,200 个探针组，覆盖了 32,167 M . truncatula EST/mRNA, 叶绿体基因探针组 ; 18,733 M . truncatula 预测基因探针组 ; 1,896 M . sativa EST/mRNA 基因探针组 ; and 8,305 S. meliloti 预测基因探针组。
P. aeruginosa Genome Array	绿脓杆菌	该芯片覆盖了 P. aeruginosa strain PA01 的基因组 , 包括 5,549 个蛋白编码序列 , 18 个 tRNA 基因 , 和 117 非 PA01 基因 , 等等
Poplar Genome Array	白杨	该基因芯片包括了 2005 年 3 月前报道的白杨约 61000 个基因。
Soy Genome Array	大豆	该芯片覆盖了 2003 年 11 月前报道的大豆 Glycine max 品种的 37500 个转录本和 Phytophthora sojae 的 15800 个转录本以及 Heterodera glycines 的 7500 个转录子。
Sugar Cane Genome Array	甘蔗	该芯片覆盖了 2004 年 8 月前 Genbank, dbEST 和 Unigene 数据库报道的 7500 个甘蔗转录子。
Tomato Genome Array	西红柿	该芯片覆盖了 2004 年 11 月前 Genbank, dbEST 和 Unigene 数据库中报道的 Lycopersicon esculentum 品种的 9200 个基因。
V. vinifera Genome Array	葡萄	葡萄的基因组芯片包括了 2003 年 10 月前 Genbank, dbEST 和 Unigene 数据库报道的有关葡萄品种的 V. vinifera 14000 个转录本和 1700 个其它葡萄品种的转录本。

同时，我们还提供芯片数据分析服务，如差异基因挑选，聚类分析，GO功能分析，信号通路分析等。

信号通路分析

聚类分析

GO功能分析

2.Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0服务

Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0芯片优势