Affymetrix公司（昂飞公司）的基因芯片为高密度寡核苷酸芯片，利用原位光刻专利技术可使一张芯片上合成多达500,000 个寡核苷酸。这种类型的芯片具有极高的特异性和灵敏度，重复性好，假阳性率非常低，是目前世界上最先进的基因芯片。因其具有强大的检测功能，己被广泛地应用于基因表达分析、基因分型和健康诊断等研究，大大加速了人类以及其它模式生物基因组学研究的进程。
我们将利用Affymetrix公司（昂飞公司）的软件系统：MicroArray Suite, MicroDB以及Data Mining
Tool 进行数据分析处理。根据客户的分析要求，我们将提供以下方面的数据及分析结果：
- jpg格式芯片扫描原始图像。
- 芯片的原始数据，包括原始的.DAT、.EXP和.CEL文件。
- Excel文件形式提供每张芯片的分析结果。包含样品中所有基因的Signal、Detection和Detection p-value等信息。
- 每张芯片的Report文件。包含样品的制备质量和芯片杂交的总体信息。
- 对不同的样本进行基因差异表达的比较分析，比较分析的次数不多于客户要求服务的芯片数。并以Excel格式提供所有基因在不同芯片中表达差异分析。得到Change
p-value, Increase 或Decrease等信息。
- 提供不同样本比较分析散点图(Scatter Graph)。可以直观地反映两者信号值强度的整体差异及分布（分析次数不超过客户要求服务的芯片数目）。
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